人健康肝组织刀豆凝集素(Con A)结合型糖蛋白组学研究

作     者：孙强玲 刘银坤 卢雯静 程钢 周海君 周信文 魏黎明 代智 郭坤 陆皓杰 

作者机构：复旦大学附属中山医院肝癌研究所教育部"癌变和侵袭原理"重点实验室上海200032 复旦大学生物医学研究院生物信息学中心上海200433 复旦大学生物医学研究院蛋白质组学研究中心上海20043 

出 版 物：《中国科学（C辑）》 (Science in China(Series C))

年 卷 期：2006年第36卷第6期

页      面：543-551页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家重点基础研究发展规划项目(973)资助(批准号:2004CB520802) 

主　　题：刀豆凝集素(Con A) 亲和层析 糖蛋白组学 人健康肝组织 

摘      要：通过凝集素亲和层析技术结合双向电泳-质谱技术构建人健康肝组织Con A结合型糖蛋白数据库并进行生物信息学分析;利用研磨和匀浆两步法抽提人健康肝组织总蛋白,通过固相凝集素亲和层析获得与刀豆凝集素(Con A)结合型糖蛋白,经过双向电泳、荧光染色、图像分析获得人健康肝组织表达谱;通过MALDI-TOF-MS质谱鉴定及生物信息学分析获得人健康肝组织数据库,并建立了高重复性的人健康肝组织Con A结合型糖蛋白表达谱,图谱均点数为301±15,挖取139个蛋白点进行质谱鉴定,去冗余后确定了85个与细胞周期、代谢通路相关的蛋白质;通过NetNGlyc和NetOGlyc对糖基化位点进行预测,并按照geneontology对其功能定位等进行分类,并对其中与肿瘤发生发展相关的蛋白进行具体分析.由此可见,凝集素亲和层析结合2-DE,质谱鉴定是一种高通量的检测方法,Con A结合型糖基化修饰谱的构建为后续研究奠定了基础.