马铃薯丝氨酸羧肽酶类蛋白StSCPL家族的鉴定及干旱胁迫响应分析

作     者：晋昕 魏玉溪 陈正亮 王泽民 张国栋 杨江伟 张宁 司怀军 JIN Xin;WEI Yuxi;CHEN Zhengliang;WANG Zemin;ZHANG Guodong;YANG Jiangwei;ZHANG Ning;SI Huaijun

作者机构：省部共建干旱生境作物学国家重点实验室甘肃兰州730070 甘肃农业大学生命科学技术学院甘肃兰州730070 忻州师范学院生物系山西忻州034099 

出 版 物：《干旱地区农业研究》 (Agricultural Research in the Arid Areas)

年 卷 期：2023年第41卷第4期

页      面：9-20页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0903[农学-农业资源与环境] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家自然科学基金(32260518) 省部共建干旱生境作物学国家重点实验室开放基金(GSCS-2022-03) 甘肃省科技厅青年科技基金(22JR5RA882,21JR7RA844) 

主　　题：马铃薯 SCPL基因家族 鉴定 胁迫响应 LncRNA 

摘      要：在全基因组水平上鉴定了马铃薯SCPL基因家族,并对其成员的基本特征、蛋白质保守结构域、进化关系和干旱胁迫下的表达模式进行了分析。同时,以干旱耐受性不同的马铃薯品种‘陇薯10号’(干旱耐受型)和‘大西洋’(干旱敏感型)为试验材料,利用高通量测序分析了干旱胁迫关键差异表达基因StSCPLs。结果表明,马铃薯中共鉴定到了41个StSCPLs,不对称分布在11条染色体中,多数成员含有多个内含子。其蛋白均含有1个细胞内分泌和转运的信号肽、底物结合位点、N-糖基化位点以及与催化作用相关的进化保守基序。在非生物胁迫下,大多数StSCPLs都具有多胁迫响应性。在干旱耐受性不同的马铃薯品种中,StSCPLs表现出差异表达特性。同时,LncRNA及其靶StSCPL介导的调控网络显示,StSCPL3和StSCPL34分别是lncRNA MSTRG.2301.1和MSTRG.19548.1的靶基因,在干旱耐受性不同的品种中显著差异表达,可能是马铃薯对干旱胁迫响应的潜在靶点。