基于线粒体COI基因的河南省境内锯齿新米虾种群遗传多样性研究

作     者：马志刚 冯梦霞 汤永涛 刘如垚 闫雪朦 胡博 聂国兴 周传江 

作者机构：河南师范大学生命科学学院 河南师范大学水产学院河南省水产动物养殖工程技术研究中心水产动物疾病控制河南省工程实验室 

出 版 物：《四川动物》 (Sichuan Journal of Zoology)

年 卷 期：2023年

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目（U2004146） 河南省科技攻关重点项目（182102110046 182102110237） 河南省创新型科技团队支持计划项目（CXTD2016043） 2019年度河南省高等学校青年骨干教师培养计划项目（2019GGJS063） 

主　　题：锯齿新米虾 COI基因 河南境内 遗传多样性 资源保护 

摘      要：为系统评估河南省锯齿新米虾Neocaridina denticulate的遗传多样性现状，本研究基于线粒体COI基因对河南省境内19个群体149尾样本进行了遗传多样性分析。结果显示，河南省境内锯齿新米虾群体包含35个单倍型，平均单倍型多样性(Hd)为0.922，平均核苷酸多样性(π)为0.006 32；长江水系群体有最高的遗传多样性(Hd=0.924，π=0.006 37)，淮河水系群体最低(Hd=0.773，π=0.002 28)，各水系均显示出单倍型多样性高、核苷酸多样性低的特点。AMOVA分析显示，锯齿新米虾群体遗传变异仅26.19%，源自不同水系之间，各水系内不同群体间及群体内个体间的变异各占35.71%和38.10%。基于COI基因的最大似然树显示，不同水系群体互相嵌套在一起，但单倍型网络图显示海河水系与其他水系存在一定程度的分化。中性检验、错配分布及贝叶斯天际线分析表明，锯齿新米虾群体近期没有发生种群扩张，群体相对稳定。本研究完善了河南省境内淡水虾类的物种名录，为后续境内淡水虾类的相关研究提供参考。