基于ITS2和psbA-trnH序列的广西不同居群的八角谱系地理学
Phylogeography of Illicium verum from Different Populations in Guangxi Based on ITS2 and psbA-trnH作者机构:广西中医药大学广西南宁530200 广西大明山国家级自然保护区管理局广西南宁530114
出 版 物:《中药材》 (Journal of Chinese Medicinal Materials)
年 卷 期:2023年第46卷第2期
页 面:320-325页
学科分类:100703[医学-生药学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 10[医学]
基 金:广西自然科学基金项目(2020GXNSFAA238017 2019GXNSFAA245084) 广西科技重大专项(桂科AA22096029) 广西壮瑶药重点实验室项目(GXZYKF2022-20) 广西研究生联合培养基地(桂学位6号) 2022年广西高校大学生创新创业训练计划项目(S202210600063)
摘 要:目的:研究八角遗传多样性、遗传结构和谱系地理分布格局,为八角品种改良、种质资源保护和合理利用奠定基础。方法:基于ITS2和psbA-trnH序列对广西13个栽培居群263株个体的八角进行谱系地理学研究。结果:八角居群ITS2和psbA-trnH拼接序列长度为872 bp,共定义了18个单倍型,居群总遗传多样性H_(t)=0.750,居群内遗传多样性H_(s)=0.680,整体单倍型多态性H_(d)=0.73952,核苷酸多态性π=0.00309。居群内和居群间的遗传距离和遗传分化系数N_(st)(0.091)与G_(st)(0.093)相差不大。系统发育树分析结果表明,不同居群的八角未呈现谱系地理结构上的区别。分子变异分析(AMOVA)显示,遗传变异来自居群内部(F_(st)=0.10645,P0.001)。居群间基因交流虽较频繁,但并未发生过显著扩张,且处于动态平衡之中。多数居群含有单倍型H4、H1和H3,其中H4出现的频率最高(37.55%)。结论:不同居群八角表现出较高的遗传多样性,但遗传变异来源于居群内部,该研究为今后八角遗传改良及新品种选育提供了必要的科学依据。