基于GBS-SNP的武夷茶树(Camellia sinensis,Synonym:Thea bohea L.)遗传分析及标记开发

作     者：李力 罗盛财 王飞权 黎巷汝 冯花 石玉涛 叶江华 刘菲 赵佳林 李舒莹 张渤 LI Li;LUO Shengcai;WANG Feiquan;LI Xiangru;FENG Hua;SHI Yutao;YE Jianghua;LIU Fei;ZHAO Jiain;LI Shuying;ZHANG Bo

作者机构：武夷学院茶与食品学院福建南平354300 武夷山市农业农村局福建南平354300 武夷学院茶叶科学研究所福建南平354300 福建农林大学园艺学院福建福州350002 

出 版 物：《茶叶科学》 (Journal of Tea Science)

年 卷 期：2023年第43卷第3期

页      面：310-324页

核心收录：

学科分类：09[农学] 090203[农学-茶学] 0901[农学-作物学] 0902[农学-园艺学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：福建省自然科学基金项目(2021J011135) 中央引导地方科技发展专项(2021L3058) 

主　　题：武夷茶 基因分型测序 遗传相似度 基因流 指纹图谱 鉴定引物 

摘      要：为深入了解武夷茶树(Camelliasinensis,异名:TheaboheaL.)的遗传多样性与背景关系,收集126个武夷茶树品种/品系与223个来自12个不同地区的优异茶树品种/品系,共349份茶树资源。采用基因分型测序(Genotyping by sequencing,GBS)技术筛选出973个高质量核心SNP进行茶树遗传多样性及背景关系分析。基于模型的遗传结构(Structure)、系统发育树(NJtree)和主成分分析(PCA)结果表明,349个茶树可分为5个亚群,亚群聚类主要是基于茶树之间的亲缘关系,而不是树型或叶形等形态特征。基因流分析表明,从闽南地区到武夷山地区和武夷山地区到浙江地区存在基因渗入。遗传相似度分析显示,在349个茶树中有136对样本的遗传相似系数大于0.9,其中有26对涉及武夷茶树品种/品系。通过两两比对的辨识度分析,从973个SNP标记中筛选出21个可100%识别349个茶树品种/品系的SNP标记,其中18个SNP标记即可100%识别126个武夷茶树品种/品系,并建立遗传指纹图谱与开发鉴定引物。研究结果为今后武夷茶树种质资源的管理和育种提供有价值的信息。