基于SNP分子标记分析菜薹的遗传多样性

作     者：缪黎明 高璐 奚丹丹 李晓锋 朱玉英 朱红芳 

作者机构：上海市农业科学院设施园艺研究所上海市设施园艺技术重点实验室 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2023年

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：上海市农业科学院绿叶菜技术创新团队(沪农科卓(2022)007)资助 

主　　题：菜薹 单核苷酸多态性 遗传多样性 群体结构分析 

摘      要：为揭示菜薹的遗传多样性和群体遗传结构，提高菜薹的种质利用效率，本研究利用Hiseq3000测序平台对29份菜薹进行了全基因组重测序。基于SNPs分子标记对菜薹的遗传结构、遗传分化程度进行了分析。数据评估结果显示，本研究获得的测序数据质量高、比对率高，共筛选4 252 428个SNPs。祖先成分分析、主成分分析及系统进化树分析发现，29份菜薹可以被分为3个亚群，亚群A含有6个成员，亚群B含有12个成员，亚群C含有11个成员。群体内成员的遗传多样性程度较低。群体间遗传多样性分析结果表明，亚群A和亚群C之间存在较高程度的遗传分化；亚群A和亚群B之间、亚群B和亚群C之间遗传分化程度更高。本研究将为菜薹优异亲本的选择及优质种质资源创新提供理论基础。