基于生物信息学分析艾叶治疗慢性荨麻疹的分子机制

作     者：种凯艳 兰祝飚 CHONG Kaiyan;LAN Zhubiao

作者机构：丽水市中医院皮肤科浙江丽水323000 

出 版 物：《中国现代医生》 (China Modern Doctor)

年 卷 期：2023年第61卷第15期

页      面：25-29页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：丽水市科技计划项目(2021SJZC042) 

主　　题：生物信息学 分子对接 慢性荨麻疹 作用机制 

摘      要：目的运用基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)基因芯片挖掘、生物信息学及分子对接技术,分析艾叶治疗慢性荨麻疹(chronic urticaria,CU)的分子机制。方法从GEO数据库下载CU的基因芯片数据集,利用R软件筛选出差异表达靶点,从中药系统药理学数据库(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database,TCMSP)、药物靶标识别平台(Pharm Mapper)等数据库获取艾叶的化学成分、药物靶点,运用GENEMANIA平台及R软件,对药物–疾病交集靶点进行蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome,KEGG)富集分析,使用AutoDock Vina等软件进行分子对接验证。结果得到CU靶点320个、药物靶点382个,筛选出药物–疾病交集靶点20个;PPI拓扑分析得出的核心靶点有ADAMTS4、FABP7、SRM、PDE5A、SOD2等;相关的化学成分有(2R)-5,7-二羟基-2-(4-羟苯基)、亚油酸乙酯、豆甾醇、槲皮素等;富集出涉及脂质和动脉粥样硬化、长寿调节信号通路、过氧化物酶体增殖活化因子受体(peroxisome proliferator-activated receptor,PPAR)信号通路、白细胞介素(interleukin,IL)-17信号通路、趋化因子信号通路等;9种化学成分与5个核心靶点间的分子对接显示,有40组对接具有结合活性(结合能–4.25kcal/mol)。结论艾叶对CU具有多靶点、多成分、多途径的作用机制,通过文献检索及分子对接验证本次分析结果具有可信性,可为后期的实验研究提供参考依据。