罗氏沼虾育苗期浮游细菌群落演替模式、驱动因素及其生物标志物

作     者：邹松保 原居林 程海华 倪蒙 刘梅 高强 ZOU Song-Bao;YUAN Ju-Lin;CHENG Hai-Hua;NI Meng;LIU Mei;GAO Qiang

作者机构：浙江省淡水水产研究所农业农村部淡水渔业健康育苗重点实验室浙江省鱼类健康与营养重点实验室湖州313001 

出 版 物：《水生生物学报》 (Acta Hydrobiologica Sinica)

年 卷 期：2023年第47卷第8期

页      面：1323-1334页

核心收录：

学科分类：07[理学] 09[农学] 0903[农学-农业资源与环境] 0713[理学-生态学] 

基　　金：湖州市科技计划(2021YZ29) 浙江省“尖兵”“领雁”研发攻关计划项目(2022C02027) 浙江省“三农九方”科技协作计划(2022SNJF068和2023SNJF075) 湖州市乡村振兴专项(2021ZD2036) 浙江省公益计划(LGF22C190001) 湖州市公益性应用研究项目(2019GZ31) 浙江省“十四五”育种专项水产协作组项目(2021C02069-4)资助 

主　　题：育苗 演替模式 环境驱动 网络分析 微生物标志物 罗氏沼虾 

摘      要：为了探究罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)育苗期浮游细菌群落的时间动态和组装机制,对3个苗种厂的全育苗周期进行持续追踪,利用16S rRNA扩增子测序评估了罗氏沼虾幼苗发育过程中浮游细菌群落的动态演替、环境驱动因素、微生物标志物和共现网络。细菌群落的α-多样性在育苗期呈U型分布规律,群落相似性遵循时间衰减模式,群落周转率为0.011。随着虾苗的发育,微杆菌科(Microbacteriaceae)(放线菌门:Actinobacteria)和冷形菌科(Cryomorphaceae)(拟杆菌门:Bacteroidetes)的相对丰度显著增加(P0.05),而拟杆菌门中的黄杆菌科(Flavobacteriaceae)和藏红花黄色线菌科(Crocinitomicaceae)的比重下降。pH是影响浮游细菌群落多样性和组成的最主要的环境驱动因素。利用随机森林分析,鉴定了12个幼苗发育相关的微生物标志物,其中伯克氏菌科(Burkholderiaceae)和圆杆菌科(Cyclobacteriaceae)分别是育苗早期(1—2d)和中期(8—10d)的指示性类群,而腐螺旋菌科(Saprospiraceae)和分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)作为标志物类群出现在中后期(16—21d)。育苗系统中菌群以正相关关系为主的共现模式随幼苗发育而减弱,而负相互作用增加。研究结果揭示了罗氏沼虾育苗期浮游细菌群落的演替动态和群落聚集模式,将为微生态调节和病害防控提供新见解。