糖尿病肾病患者Piwi相互作用RNA差异表达谱分析

作     者：雷寓淇 周思捷 乔颖进 高丹 刘风勋 吕林晓 潘少康 刘东伟 刘章锁 Lei Yuqi;Zhou Sijie;Qiao Yingjin;Gao Dan;Liu Fengxun;Lyu Linxiao;Pan Shaokang;Liu Dongwei;Liu Zhangsuo

作者机构：郑州大学第一附属医院中西医结合肾病科郑州大学肾脏病研究所河南省肾脏病研究中心河南省慢性肾脏病精准诊疗重点实验室郑州450052 

出 版 物：《中华肾脏病杂志》 (Chinese Journal of Nephrology)

年 卷 期：2023年第39卷第4期

页      面：253-262页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金联合项目(U21A20348) 国家自然科学基金青年项目(81800648) 河南优秀青年科学基金项目(202300410363)。 

主　　题：糖尿病肾病 RNA/未翻译 RNA/小分子干扰 高通量测序 生物信息学分析 

摘      要：目的探究Piwi相互作用RNA(Piwi-interacting RNA,piRNA)与糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)的相关性。方法使用高通量测序技术检测DN患者肾组织(实验组)及肾肿瘤患者肿瘤旁肾组织(对照组)中piRNA的差异表达谱,通过基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析对差异表达piRNA的生物学功能进行阐述。采用实时荧光定量PCR检测目标piRNA在DN患者血清中的表达水平。采用Spearman相关分析法分析血清目标piRNA与DN患者临床指标之间的相关性。结果高通量测序结果显示,以|log2差异倍数|≥2且P0.05为筛选条件,与对照组相比,DN组显著差异表达的piRNA共127个,其中99个表达上调,28个表达下调,上调前5位的piRNA分别是piRNA-hsa-161686、piRNA-hsa-349255、piRNA-hsa-355720、piRNA-hsa-151229及piRNA-hsa-154959,下调前5位的piRNA分别是piRNA-hsa-1929960、piRNA-hsa-174194、piRNA-hsa-148658、piRNA-hsa-172594及piRNA-hsa-172421。PCR验证P值较小且表达量较高的3个上调和3个下调基因,结果显示,血清piRNA-hsa-77976的表达在DN患者中显著下调(P=0.028),与测序结果一致,其余基因表达与测序结果不一致或差异无统计学意义。生物信息学分析预测显示显著差异表达的piRNA可能通过Rap1、Ras、PI3K-Akt及轴突导向通路参与DN的调控。相关性分析结果显示,piRNA-hsa-77976表达与血尿素氮(r=-0.584,P=0.028)、血肌酐(r=-0.637,P=0.014)、胱抑素C(r=-0.738,P=0.003)及β2微球蛋白(r=-0.822,P0.001)均呈负相关,与估算肾小球滤过率(r=0.661,P=0.010)呈正相关。结论piRNA差异表达与DN密切相关,或可作为DN诊断及预后评估的新型生物标志物。