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基于深度学习的PPI关系抽取方法研究进展

RESEARCH PROGRESS OF PROTEIN-PROTEIN INTERACTION RELATIONSHIP EXTRACTION METHODS BASED ON DEEP LEARNING

作     者:唐詹 王龙鹤 郭旭超 周晗 刁磊 李林 Tang Zhan;Wang Longhe;Guo Xuchao;Zhou Han;Diao LeiLi Lin

作者机构:中国农业大学信息与电气工程学院北京100085 

出 版 物:《计算机应用与软件》 (Computer Applications and Software)

年 卷 期:2023年第40卷第5期

页      面:1-9页

学科分类:081203[工学-计算机应用技术] 08[工学] 0835[工学-软件工程] 0812[工学-计算机科学与技术(可授工学、理学学位)] 

基  金:国家重点研发计划项目(2016YFD0300710) 

主  题:蛋白质间相互作用 关系抽取 深度学习 自然语言处理 

摘      要:蛋白质间相互作用(protein-protein interaction,PPI)在几乎全部的生命活动中发挥着极其重要的作用,如何准确、高效地自动化抽取出科学文献中的PPI关系有着十分重要的研究意义。深度学习作为机器学习的一个重要分支,由于其强大的学习能力和特征提取能力,在PPI关系抽取领域得到了广大研究者的关注。对现有基于深度学习的PPI关系抽取方法进行阐述,对这些方法的实验数据及其构成组件进行对比分析,总结这些方法存在的问题,展望可以改进的研究方向。

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