SH3TC2促进结直肠癌的发生与进展——基于生信分析

作     者：陈德合 夏天红 岳婷 李洪涛 CHEN De;XIA Tianhong;YUE Ting;Li Hongtao

作者机构：宁夏医科大学银川750000 解放军联勤保障部队第940医院兰州730050 商丘市第五人民医院商丘476000 甘肃省干细胞与基因药物重点实验室兰州730050 

出 版 物：《河南大学学报（医学版）》 (Journal of Henan University:Medical Science)

年 卷 期：2023年第42卷第2期

页      面：114-120,127页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：部队专项培育面上项目(2021YXKY021) 科技部、财政部惠民计划资助项目(2012GS620101) 

主　　题：结直肠癌 SH3TC2 预后 生存 

摘      要：目的:基于TCGA和GTEx样本数据信息挖掘在结直肠癌中异常表达且与预后相关的基因,以期提高其诊疗效果和改善预后生存。方法:利用GEPIA 2.0可视化分析平台对公共数据库中癌及癌旁1034个组织标本数据进行差异表达和预后生存相关mRNA筛选,使用FunRich软件通过韦恩图筛选共同差异基因并进行GO和KEGG富集分析,再通过GEPIA2.0和UALCAN数据库进行关键差异基因的表达和预后验证;接着通过TIMER2.0数据库探索关键基因的表达水平与免疫细胞浸润的相关性;最后通过STRING数据库在线进一步分析关键基因的蛋白相互作用网络。结果:共筛选到11106个差异表达基因(结肠癌5337个,直肠癌5769个),与二者预后OS及DFS相关的500个基因取交集,筛选出BGLAP、COQ2、CRLF1、PREX2、SH3TC2、PTPRM、ZNF154、HOXA4等8个表达差异基因且与预后生存DFS相关。验证后发现BGLAP、COQ2、CRLF1、PREX2、PTPRM、ZNF154、HOXA4可能在癌症的不同阶段发挥促癌、抑癌的双重功能;仅SH3TC2在结直肠癌中高表达(P0.05);其表达水平与肿瘤免疫浸润评估显示结肠癌与CD4+T细胞浸润相关性,最高仅0.124(P=0.013),直肠癌中与免疫细胞浸润相关性无统计学意义(P0.05);STRING数据库分析提示SH3TC2与SBF2、LITAF、MTMR2、MTMR2、GDAP1等蛋白相互作用可能性较大。结论:SH3TC2在结直肠癌中高表达,且高表达患者预后DFS更短,有可能是结直肠癌新的潜在诊断和预后DFS判断的标志物;SH3TC2表达水平在结直肠癌中与免疫细胞浸润相关性较弱。