基于网络药理学和分子对接探讨宁夏枸杞子中抑制免疫的成分及作用机制

作     者：许地元 乔亚玲 才让南加 林鹏程 海平 Xu Diyuan;Qiao Yaling;Cairang Nanjia;Lin Pengcheng;Hai Ping

作者机构：青海民族大学药学院西宁810007 青海省药品检验检测院/国家药品监督管理局中药(藏药)质量控制重点实验室/青海省中藏药现代化研究重点实验室西宁810016 青海省青藏高原植物化学重点实验室西宁810007 

出 版 物：《青海科技》 (Qinghai Science and Technology)

年 卷 期：2023年第30卷第2期

页      面：88-99页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：青海省科技计划项目(2020-SF-C32) 

主　　题：宁夏枸杞子 PD-1 PD-L1 N-E-coumaroyl tyramine 网络药理学 分子对接 

摘      要：通过网络药理学和分子对接技术,探究宁夏枸杞子乙酸乙酯萃取物中抑制程序性细胞死亡蛋白-1及其配体的活性成分及作用机制。通过检索文献和SwissTargetPrediction数据库,筛选出宁夏枸杞子乙酸乙酯萃取物中的成分及其对应靶点。在UniProt、OMIM、DrugBank和GeneCards数据库获取免疫相关靶点。采用Cytoscape软件构建化合物-关键免疫靶点-免疫通路网络图。运用String数据库构建蛋白质相互作用网络图(PPI)。利用DAVID数据库对关键免疫靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。使用AutoDock Vina软件进行分子对接。宁夏枸杞子乙酸乙酯萃取物中活性成分共44种,活性成分与免疫交集靶点169个。PPI网络核心靶点有表皮生长因子受体(EGFR)、脾酪氨酸激酶(SYK)、雌激素受体(ESR1)等。GO富集显示活性成分可能通过蛋白磷酸化、肽基-酪氨酸自磷酸化、蛋白酪氨酸激酶活性等发挥抗免疫作用;KEGG通路显示活性成分可能通过FcεRI信号通路、B细胞受体信号通路、T细胞受体信号通路发挥作用;分子对接结果显示,化合物lyciumamide C、lyciumamide B与N-E-coumaroyl tyramine具有抑制PD-1/PD-L1的活性,核心蛋白与关键化合物之间的作用力主要是疏水相互作用、氢键和π-堆叠。宁夏枸杞子乙酸乙酯萃取物可通过多个靶点、多个通路发挥免疫抑制作用,lyciumamide C、lyciumamide B与N-E-coumaroyl tyramine是抑制PD-1/PD-L1的主要化合物。