扎那纹胸鮡g型溶菌酶的cDNA克隆及组织表达分析

作     者：王运娇 吕梦 蔡莎莎 Wang Yunjiao;Lv Meng;Cai Shasha

作者机构：山东第一医科大学(山东省医学科学院)研究生院济南250000 

出 版 物：《安徽医科大学学报》 (Acta Universitatis Medicinalis Anhui)

年 卷 期：2023年第58卷第5期

页      面：711-717页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071002[理学-动物学] 

基　　金：国家自然科学基金(编号:31900328) 济宁医学院教育教学研究项目(编号:Y2020018) 

主　　题：扎那纹胸鮡 g型溶菌酶 生物信息学分析 组织表达谱 

摘      要：目的鉴定扎那纹胸鮡g型溶菌酶(GzLysG)编码序列,分析其在宿主免疫系统中的作用。方法通过巢氏PCR技术克隆了GzLysG cDNA序列,通过ExPASy、SignalP 5.0、CDD、Clustal Omega等在线软件对GzLysG蛋白进行生物信息学分析,利用RT-qPCR技术分析了GzLysG mRNA在不同组织中的表达情况。结果GzLysG cDNA的开放阅读框全长558 bp,编码185个氨基酸,其蛋白序列分子量为20478.20 u,理论等电点为9.16,是一种稳定的碱性亲水性蛋白质。该蛋白无信号肽,含有g型溶菌酶典型的催化活性位点、GEWL结构域和SLT结构域。高级结构分析发现,GzLysG蛋白以α螺旋和无规则卷曲结构为主,其分子表面有一条与溶菌酶活性密切相关的狭长裂缝。系统进化分析表明溶菌酶在物种进化过程中较为保守,且GzLysG与斑马鱼来源的溶菌酶表现出较近的亲缘关系。组织表达谱分析发现,GzLysG mRNA在免疫保护相关的皮肤、肌肉和鳃组织中具有较高表达量。结论GzLysG在扎那纹胸鮡固有免疫防御中可能发挥重要作用。