胡杨超氧化物歧化酶基因家族耐逆境的分子机理研究

作     者：鲁松松 白丽霞 姚耀源 张晓玮 Lu Songsong;Bai Lixia;Yao Yaoyuan;Zhang Xiaowei

作者机构：甘肃农业大学林学院甘肃兰州730070 

出 版 物：《西南林业大学学报（自然科学）》 (Journal of Southwest Forestry University：Natural Sciences)

年 卷 期：2023年第43卷第3期

页      面：42-55页

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：甘肃省青年科技基金项目(18JR3RA188,18JR3RA184)资助 甘肃农业大学科技创新基金—学科建设专项基金项目(GAU-XKJS-2018-101)资助 甘肃农业大学科技创新基金—公招博士科研启动基金项目(2017RCZX-23)资助 

主　　题：胡杨 超氧化物歧化酶 基因鉴定 基因表达 蛋白质结构 胁迫 

摘      要：以已有基因组或转录物组数据的杨柳科树种为参考,采用生物信息学的常规方法,对胡杨SOD基因家族现状、同源关系、蛋白质三维结构及各家族成员对盐胁迫的响应等方面进行了较为系统的分析,以探索其分子水平的适应机理。结果表明:杨柳科树种基因组中SOD基因家族由Cu,Zn-SOD(CSD)、Mn-SOD(MSD)、Fe-SOD(FSD)3个亚家族组成,胡杨基因组中分别含有7、3、2个SOD基因亚家族成员,其中FSD3已被假基因化而失去功能,FSD1基因在胡杨叶组织中被高表达。MSD亚家族基因在胡杨和毛果杨的根和叶愈伤组织中均具有较高表达量,MSD1基因是盐胁迫条件下唯一持续上调的基因;MSD1(187K-T和202H-N)和MSD2(97R-N)3个氨基酸突变引起四聚体亚基间相互作用增强,使得2种MSD亚型均具有较高的蛋白质稳定性,有利于蛋白质积累到较高的浓度。