线粒体12S与COI条形码对海洋鱼类的鉴定差异

作     者：陈治 高天翔 CHEN Zhi;GAO Tianxiang

作者机构：海南热带海洋学院热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室海南三亚572022 浙江海洋大学水产学院浙江舟山316022 

出 版 物：《海南热带海洋学院学报》 (Journal of Hainan Tropical Ocean University)

年 卷 期：2023年第30卷第2期

页      面：10-16页

学科分类：090803[农学-渔业资源] 0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金青年科学基金项目(32002389) 海南省自然科学基金高层次人才项目(422RC717) 海南热带海洋学院引进人才科研启动资助项目(RHDRC201907) 

主　　题：海洋鱼类 12S rRNA基因 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ 条形码 物种鉴定 

摘      要：本研究基于145种常见海洋鱼类比较了使用12S与COI条形码鉴定物种的差异。结果如下:(1)145种鱼类共测得12S序列528条,所测鱼类基于12S条形码的种内遗传距离在0~0.0068之间,最小种间遗传距离为0~0.4162;有7种鱼类的种内遗传距离过大(大于0.0055),且NJ系统发生树中存在不同鱼类聚于同一组内,种与种之间不分界的现象。(2)145种鱼类共测得COI序列686条,所测鱼类基于COI条形码的种内遗传距离在0~0.0049之间,种间遗传距离均大于0.02,且至少为种内遗传距离的15.28倍;NJ系统发生树显示,各鱼类聚于不同组内,种与种之间分界明显。结果表明,基于12S基因的鱼类DNA条形码的物种鉴定存在物种注释假阴性或假阳性风险,应尽可能考虑使用COI条形码,以提高物种鉴定的准确性。