黄河鲤胰岛素诱导基因1(INSIG1)序列特征、SNP位点及其与生长性状的关联分析

作     者：王新华 路畅 徐文彦 齐子鑫 徐梦梦 WANG Xinhua;LU Chang;XU Wenyan;QI Zixin;XU Mengmeng

作者机构：河南牧业经济学院动物科技学院河南郑州450046 中国海洋大学水产学院山东青岛266000 

出 版 物：《大连海洋大学学报》 (Journal of Dalian Ocean University)

年 卷 期：2023年第38卷第5期

页      面：763-771页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：河南省重点研发与推广专项(科技攻关)(232102110004,232102110112,222102110063) 河南省现代农业产业技术体系建设专项(HARS-22-16-Z1) 

主　　题：黄河鲤 胰岛素诱导基因(INSIG1) 组织表达 SNP位点 生长关联性 

摘      要：为探究胰岛素诱导基因1(insulin-induced gene,INSIG1)在黄河鲤(Cyprinus carpio haematoperus)生长发育过程中的作用,采用候选基因法对黄河鲤生长候选基因INSIG1进行了序列特征分析、组织表达及SNP与生长性状的关联分析。结果表明:黄河鲤INSIG1基因全长为4853 bp,包含5个外显子和4个内含子,其中cDNA全长为1530 bp,蛋白编码区(CDS)全长为756 bp,可编码251个氨基酸;INSIG1在不同物种间序列保守性较高,黄河鲤INSIG1与金线鲃、斑马鱼和鲫等鲤科鱼类聚为一支;预测黄河鲤INSIG1蛋白相对分子质量为27674.25,理论等电点为8.09,属于稳定的疏水性蛋白,该蛋白无信号肽,包含6个跨膜结构,蛋白三级结构包含6个α-螺旋和部分无规则卷曲;qRT-PCR分析显示,INSIG1基因在黄河鲤肝、脾、肾、肠、心脏、鳃、脑、肌肉和皮肤等组织中均有表达,其中在肠和肝组织中表达量较高,在鳃组织中表达量最低;黄河鲤INSIG1基因共鉴定到10个SNP位点,其中g.1854TC和g.1982AT 2个SNP位点的不同基因型与黄河鲤肥满度性状显著相关(PC和g.1982AT显著影响了黄河鲤的肥满度,该结果为黄河鲤生长性状的分子标记辅助育种提供了可用的分子标记,对于选育具有优良性状的黄河鲤具有重要的实践意义。