甘薯近缘野生种ISBP分子标记的开发及其在遗传多样性分析和品种鉴定中的应用

作     者：孟羽莎 王寅 赖齐贤 刘雷 项超 吴永华 郑嫣然 顾兴国 方豪 苗苗 吴列洪 汤勇 MENG Yusha;WANG Yin;LAI Qixian;LIU Lei;XIANG Chao;WU Yonghua;ZHENG Yanran;GU Xingguo;FANG Hao;MIAO Miao;WU Liehong;TANG Yong

作者机构：浙江省农业科学院农村发展研究所浙江杭州310021 农业农村部创意农业重点实验室浙江杭州310021 浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所浙江杭州310021 

出 版 物：《浙江农业学报》 (Acta Agriculturae Zhejiangensis)

年 卷 期：2023年第35卷第3期

页      面：489-498页

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：浙江省重点研发计划(2021C04028) 

主　　题：甘薯 ISBP LTR 分子标记 遗传多样性 品种鉴定 

摘      要：从甘薯近缘野生种Ipomoea triloba和Ipomoea trifida的基因组测序序列中鉴定出2360条长末端重复反转座子(long terminal repeat retrotransposons,LTR-RT)序列,在此基础上开发了100对基于插入位点的多态性(insertion-site-based polymorphisms,ISBP)引物,并利用4份甘薯种质资源对开发的ISBP引物进行多态性评估,发现24对ISBP引物具有较高的多态性,随后将其应用于浙江省收集的56份甘薯种质资源的遗传多样性分析和品种鉴定。结果显示,24对ISBP引物在56份种质资源中共产生182条多态性条带,且每份种质资源都有独特的指纹信息。NTsys遗传分析结果显示,群体内不同种质资源之间的遗传距离从0.0275至0.6538,平均为0.3732,引物多态性信息含量(polymorphic information content,PIC)平均为0.2896,UPGMA和PCA结果显示,这些群体共被分为两个大群,分别包含11和45份种质资源。以上研究表明,该群体的遗传变异较小,不同种质资源之间的遗传背景狭窄。本研究开发的ISBP引物一方面增加了甘薯中逆转座子分子标记的数量,填补了ISBP标记在甘薯遗传分析中应用的空白,另一方面为甘薯品种资源鉴定、保护与利用提供了有力工具。