一起腹泻疫情病原体鉴定及腺病毒F41型基因组遗传特征分析

作     者：王云潇 周宏 张勇 倪楠 侯佩强 史卫峰 Wang Yunxiao;Zhou Hong;Zhang Yong;Ni Nan;Hou Peiqiang;Shi Weifeng

作者机构：山东第一医科大学(山东省医学科学院)公共卫生与健康管理学院山东济南250117 山东第一医科大学(山东省医学科学院)临床与基础医学院山东济南250117 泰安市泰山区疾病预防控制中心山东泰安271001 泰安市疾病预防控制中心山东泰安271021 

出 版 物：《生物医学转化》 (Biomedical transformation)

年 卷 期：2023年第4卷第1期

页      面：15-23页

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：山东第一医科大学学术提升计划项目(2019QL006) 山东省医药卫生科技发展计划项目(2018WS129) 

主　　题：腺病毒F41亚型 腹泻 高通量测序 遗传特征分析 

摘      要：目的鉴定引起山东省泰安市某学校腹泻疫情的病原体,并对其基因组进行遗传特征分析。方法利用荧光定量PCR方法对本起疫情中收集到的19份腹泻患者及餐厅工作人员的肛拭子、环境样本进行常见腹泻病毒性病原体检测,随后利用高通量测序方法获得阳性样本的病毒基因组序列,并对病毒全基因组序列进行核苷酸和氨基酸序列相似性比较、系统发育分析。结果19份样本中有7份样本被鉴定为腺病毒阳性,阳性检出率为36.8%;在患者10和患者4餐具样本中测序获得了腺病毒F41型毒株的全基因组序列,两株病毒核苷酸、氨基酸相似性均为100%。基于全基因组、六邻体基因、纤突蛋白基因的系统发育分析表明,本研究的HAdV-F41毒株与中国、美国、日本、伊拉克等国家分离到的毒株亲缘性较高。结论本次泰安地区儿童腹泻疫情是由腺病毒F41型感染引起,且与中国、美国等毒株亲缘性较高,丰富了山东省腺病毒F41型毒株的遗传特征资料,为腺病毒引起的儿童腹泻的防治提供了理论依据。