云南西双版纳百日咳博德特氏菌分离株抗原基因特征分析

作     者：张梦瑶 何美燕 左伟伦 何燕琴 蔡路奎 温嘉纳 杨玲 廖宏玮 梁疆莉 ZHANG Meng-yao;HE Mei-yan;ZUO Wei-lun

作者机构：中国医学科学院医学生物学研究所云南昆明650118 云南大学 西双版纳傣族自治州人民医院呼吸与危重症医学科 

出 版 物：《中国公共卫生》 (Chinese Journal of Public Health)

年 卷 期：2023年第39卷第2期

页      面：245-248页

核心收录：

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：云南省创新疫苗技术与产业转化研发平台(202002AA100009) 昆明市科技局重点项目(2019-1-N-25318000003332)。 

主　　题：百日咳博德特氏菌 临床分离株 疫苗株 序列比对 

摘      要：目的比对云南省西双版纳地区新的百日咳临床分离株与疫苗株及其他地区流行的百日咳博德特氏菌基因特征,为百日咳的防控提供科学依据。方法对2019年10—12月从云南省西双版纳州人民医院采集的4株百日咳临床分离流行株进行全基因组测序,利用MegAlign 7.1.0软件确定分离株的ptxP、ptxA、prn、fim3基因型,并与我国无细胞百日咳疫苗株CS株以及NCBI数据库中公开的其他国家和地区流行的百日咳博德特氏菌ptxP、ptxA、prn、fim3抗原基因特征进行对比分析;使用RAxML软件基于对28株百日咳博德特氏菌全基因组SNP构建系统发育树。结果云南西双版纳4株百日咳临床分离株BP-L1、BP-L2、BP-L3、BP-L4基因组比CS株多产生了33~36个插入序列引起的基因重排。4株百日咳临床分离流行株的ptxP、ptxA、prn、fim3基因序列与CS株相似度在99.2%~100%。系统发育树结果显示,CS株与参考株TohamaⅠ聚为1支,形成独立进化分支;近年来全球流行的百日咳博德特氏菌分成2个聚类,BP-L1、BP-L4与多数欧美国家百日咳博德特氏菌聚为1支,主要为ptxP3/ptxA1/prn2型菌株,BP-L2、BP-L3与亚洲国家和地区的流行的百日咳博德特氏菌聚为1支,主要是ptxP1/ptxA1/prn1型菌株。结论云南西双版纳临床分离株与疫苗株相比,主要毒力蛋白基因和进化分支发生了明显变化,与近年来国际流行的百日咳博德特氏菌遗传进化一致。