含亚甲基缩醛键的寡脱氧核苷酸的合成及杂交性质的初步研究
Synthesis and hybridizing properties of oligodeoxynucleotide analogs containing methyleneformacetal作者机构:第二军医大学药学院上海200433
出 版 物:《药学学报》 (Acta Pharmaceutica Sinica)
年 卷 期:2003年第38卷第1期
页 面:27-31页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 100701[医学-药物化学]
主 题:反义药物 寡脱氧核苷酸 解链温度 杂交 MBO 亚甲基缩醛键
摘 要:目的 本文设计合成了一类新型混合骨架的寡脱氧核苷酸 (MBO)。方法 3′ O (二苯膦酰氧 )甲基缩醛核苷 (1)在三甲基硅三氟甲磺酸酯 (TMSOTf)条件下 ,与 3′ 位保护的脱氧核苷 (2或 6 )缩合。得到的二聚 (3)或三聚体 (7)的 5′ 位经 4 ,4′ 二甲氧三苯甲基 (DMTr)保护 ,3′ 位与 (2 氰乙基N ,N 二异丙基 )氯化亚磷酰胺缩合 ,然后应用标准固相DNA合成法掺入到寡核苷酸中。结果 本文合成了 6条带亚甲基缩醛键的寡核苷酸 (ODN II~ODN VII) ,考察了它们的杂交性质 ,测定了与互补DNA的解链温度Tm 值。结论 此类寡核苷酸平均每个亚甲基缩醛键的修饰 ,解链温度Tm 值下降约 0 8~ 1 2℃ ,杂交亲和力与对照的天然磷酸二酯键的寡核苷酸相当。