第一性原理方法预测水相核酸碱基及其代谢物的氧化还原电动势(英文)

作     者：李敏杰 刘卫霞 彭淳容 陆文聪 LI Min-Jie;LIU Wei-Xia;PENG Chun-Rong;LU Wen-Cong

作者机构：上海大学化学系上海200444 

出 版 物：《物理化学学报》 (Acta Physico-Chimica Sinica)

年 卷 期：2011年第27卷第3期

页      面：595-603页

核心收录：

学科分类：081704[工学-应用化学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 0703[理学-化学] 0702[理学-物理学] 

基　　金：supported by the National Natural Science Foundation of China(20902056) Innovation Foundation of Shanghai University,China(A.10-0101-08-423) Leading Academic Discipline Project of Shanghai Municipal Education Commission,China(J50101)~~ 

主　　题：第一性原理方法 氧化还原电动势 核酸碱基 代谢物 水相 

摘      要：氧化还原电动势是了解核酸中电荷/电子转移过程以及设计具有新型氧化还原活性的碱基类化合物的重要参数.本文对82个芳香化合物的氧化还原电动势进行理论预测,通过计算值和实验值的比较发现:气相采用B3LYP/6-311++G(2df,2p)//B3LYP/6-31+G(d)方法,液相采用HF-COSMORS/UAHF方法,对运用HF-CPCM/UAHF方法在水相重新优化的构型计算溶剂化能,能有效预测芳香化合物水相氧化还原电动势,该理论方法计算的绝对均方根误差(RMSD)为0.124V.运用该理论方法成功预测了属于芳香化合物的核酸碱基及其代谢物的水相氧化还原电动势.根据预测结果,讨论了核酸中电荷/电子转移过程以及结构改变对设计具有新型氧化还原活性的核酸碱基类化合物的影响.本文为设计具有氧化还原活性的新型核酸碱基类化合物提供了一种理论方法.