大麦根系响应湿害胁迫的转录组分析
Transcriptome Analysis of Barley Root in Response to Waterlogging Stress作者机构:盐城师范学院江苏盐城224002 江苏沿海地区农业科学研究所江苏盐城224002 盐城市粮油作物技术指导站江苏盐城224002
出 版 物:《麦类作物学报》 (Journal of Triticeae Crops)
年 卷 期:2023年第43卷第2期
页 面:150-156页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种]
基 金:啤酒大麦产量与质量协同技术推广计划项目(2020-ZYXT-04-2) 江苏省自然科学基金项目(BK20201215) 国家大麦青稞产业技术体系专项(CARS-05) 江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室开放课题项目(PL202102) 江苏现代农业(特粮特经)产业技术体系啤酒大麦创新团队项目(JATS228)
摘 要:湿害是影响大麦产量和品质的主要非生物胁迫之一。为进一步明确大麦响应湿害胁迫的应答机理,本研究以耐湿大麦品种泰兴9425为材料,利用高通量转录组测序(RNA-seq)技术,比较不同湿害胁迫时间下的基因表达差异。结果表明,湿害胁迫12 h后获得1436个差异表达基因,而胁迫48 h后获得2090个差异表达基因,其中共同上调表达基因286个。GO富集分析发现,涉及代谢过程、细胞膜、催化活性等的差异表达基因占比最多。KEGG富集分析发现,差异表达基因主要富集于糖酵解、类黄酮生物合成、乙烯合成等代谢通路。对7个耐湿相关的候选基因进行qRT-PCR分析,发现差异表达基因的表达量变化趋势与RNA-seq结果一致。