桃花花型(铃形/蔷薇形)基因型鉴定、分子标记开发与利用

作     者：吉爽秋 王力荣 李勇 朱更瑞 曹珂 方伟超 陈昌文 王新卫 张琦 吴金龙 JI Shuangqiu;WANG Lirong;LI Yong;ZHU Gengrui;CAO Ke;FANGWeichao;CHEN Changwen;WANG Xinwei;ZHANG Qi;WU Jinlong

作者机构：塔里木大学园艺与林学院新疆阿拉尔843300 中国农业科学院郑州果树研究所郑州450009 

出 版 物：《果树学报》 (Journal of Fruit Science)

年 卷 期：2023年第40卷第3期

页      面：422-431页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：新疆维吾尔自治区研究生科研创新项目(XJ2022G246) 中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-ZZFR-01)。 

主　　题：桃 花型 全基因组关联分析(GWAS) IGV 竞争性等位基因特异性PCR(KASP) 

摘      要：【目的】进一步完善桃花型基因型分类,开发桃花型相关分子标记,为观赏桃花的分子辅助育种提供理论支持。【方法】利用全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)、IGV可视化软件分析,以及竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele-specific PCR,KASP)技术,在定位到的候选位点进行鉴定分析。【结果】GWAS定位分析在Pp08:14518604~14521291 bp存在一个ms179810转座子的缺失,x2验证结果表明,转座子的插入与缺失与花型性状无显著性关系。在转座子上游33980 bp处鉴定到一个单碱基核苷酸(SNP)变异,变异类型分为CC型、AC型、AA型3种,比对结果显示基因型为CC型、AC型,其表型为铃形,基因型为AA型,其表型为蔷薇形,在145份桃自然群体中鉴定准确率为98.62%。但是通过表型比对发现,基因型为CC时,铃形花冠直径为(1.54±0.46)cm,同时,基因型杂合的中蟠17号自交群体后代192株中基因型与表型准确率在98.44%。【结论】根据桃基因组中Pp08:14484624 bp处的变异类型以及桃花型的调查结果,首次将铃形花基因型细分为纯合铃形和杂合铃形,且开发了同时鉴定纯合铃形、杂合铃形及蔷薇形的分子标记。