深圳市一起新型冠状病毒Omicron BF.7变异株暴发疫情的流行病学特征

作     者：程雁鹏 孔东锋 张佳 吕子全 陈志高 熊华威 路滟 罗青山 吕秋莹 赵锦 温莹 万佳 陆芳芳 逯建华 邹旋 张振 Cheng Yanpeng;Kong Dongfeng;Zhang Jia;Lyu Ziquan;Chen Zhigao;Xiong Huawei;Lu YanLuo Qingshan;Lyu Qiuying;Zhao Jin;Wen Ying;Wan Jia;Lu Fangfang;Lu Jianhua;Zou XuanZhang Zhen

作者机构：深圳市疾病预防控制中心传染病预防控制所深圳518055 深圳市疾病预防控制中心中心实验室深圳518055 深圳市疾病预防控制中心艾滋病预防控制所深圳518055 深圳市宝安区公共卫生福永分中心深圳518103 深圳市疾病预防控制中心办公室深圳518055 

出 版 物：《中华流行病学杂志》 (Chinese Journal of Epidemiology)

年 卷 期：2023年第44卷第3期

页      面：379-385页

核心收录：

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：深圳市医学重点学科(SZXK064) 深圳市医疗卫生三名工程项目(SZSM202011008) 

主　　题：新型冠状病毒感染 新型冠状病毒 Omicron变异株 流行病学特征 传播链 

摘      要：目的分析深圳市一起广东省外输入的新型冠状病毒(新冠病毒)Omicron BF.7变异株所致暴发疫情的流行病学特征,梳理和分析其传播链条和传播特征。方法采用现场流行病学方法对病例进行调查,整理新冠病毒感染者活动轨迹、分析代际关系等,对新冠病毒核酸阳性标本进行基因测序分析。结果2022年10月8-23日,深圳市共报告196例新冠病毒感染者,均存在流行病学关联。男、女性分别为100和96例,年龄M(Q_(1),Q_(3))为33(25,46)岁。本起疫情由在广东省外旅游返回深圳市的新冠病毒感染者(首发病例)引起,4条传播链分别为首发病例现住址相关感染8例、7日晚社会面活动相关感染65例、8日写字楼工作场所相关感染累计48例、在工作场所附近的写字楼相关感染74例。本起疫情潜伏期M(Q_(1),Q_(3))为1.44(1.11,2.17)d。室内暴露的潜伏期短于室外暴露的潜伏期,M(Q_(1),Q_(3))分别为1.38(1.06,1.84)和1.95(1.22,2.99)d,差异有统计学意义(Waldχ^(2)=10.27,P=0.001)。随着代际的增加,基因位点突变个数及突变比例增加。在同一传播链疫情时,传播1代的新增基因突变位点1~3个的占比较高。结论本起疫情传播链清晰,新冠病毒Omicron BF.7变异株的潜伏期短,传播速度快,基因突变比例较高。在疫情处置时,应加快疫情处置速度,严格落实防控政策。