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数据库中细菌与人源药物代谢酶的比较及肠道菌群对药物代谢影响的展望

Comparison of bacterial and human drug metabolizing enzymes in database and prospect of influence of intestinal bacteria on drug metabolism

作     者:皇甫逸凡 冉雨叶 封硕 李菁 HUANGFU Yifan;RAN Yuye;FENG Shuo;LI Jing

作者机构:中国药科大学生命科学与技术学院南京210009 中国药科大学药物质量与安全预警教育部重点实验室南京210009 复杂基质样本生物分析湖南省重点实验室长沙410000 

出 版 物:《中国药科大学学报》 (Journal of China Pharmaceutical University)

年 卷 期:2023年第54卷第1期

页      面:122-130页

核心收录:

学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100706[医学-药理学] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基  金:国家自然科学基金资助项目(No.32170062) 复杂基质样本生物分析湖南省重点实验室资助项目(No.2017TP1037) 江苏省研究生科研与实践创新计划资助项目(No.3322200020) 

主  题:肠道菌群 药物代谢 代谢酶 人工智能 

摘      要:聚焦药物代谢相关的各种数据库和文献,对细菌来源与人源药物代谢酶的相关信息进行整理与分析,比较数据库中细菌与人源药物代谢酶收录信息的异同。结果发现细菌来源药物代谢酶比人源药物代谢酶要多很多(9703 vs 964),但是细菌来源药物代谢酶的数量相较于BRENDA数据库中细菌酶的总体数量却少很多(9703 vs 20835235)。这说明细菌对药物代谢的影响可能被大大地低估,需要进行深入的系统性研究。本文总结了目前研究肠道菌群影响药物代谢的进展及不足,提出研究思路,即通过人工智能对肠道细菌来源蛋白是否具有药物代谢的能力进行预测,用基因编辑与体内外实验等方法进行生物学功能的验证,并建立注释功能完善的肠道菌群与药物代谢相关数据库,为如何深入挖掘肠道菌群对药物代谢影响的研究提供坚实的理论基础。

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