桃儿七叶绿体基因组特征及系统发育分析

作     者：赵敏 王久利 马录花 李以康 周华坤 

作者机构：中国科学院西北高原生物研究所青海省寒区恢复生态学重点实验室 青海民族大学生态环境与资源学院 中国科学院大学 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2023年

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：青海省应用基础研究项目(2019-ZJ-7072)资助 

主　　题：桃儿七 叶绿体基因组 序列特征 系统发育分析 

摘      要：桃儿七(Sinopodophyllum hexandrum)是一种重要药用植物，本研究以美国国家生物技术信息中心已公布的桃儿七叶绿体基因组数据为基础，研究了桃儿七叶绿体基因组特征及系统发育关系。结果表明桃儿七叶绿体基因组具有典型的被子植物叶绿体基因组的四分体环状结构，包括一大一小两个单拷贝区和两个反向互补的重复区，基因组的GC含量为38.5%；一共有116个编码基因，包括60个自我复制相关基因，44个光合作用相关基因，6个其他基因和6个未知功能基因；其中tRNA共有31个，rRNA为4个；桃儿七叶绿体基因组在LSC/IR边界相对保守，而在SSC/IR边界多变；蛋白编码基因也更偏向于利用A、U进行编码；基因组存在多个SSR位点和散在重复序列；基于16个小檗科物种的系统发育分析发现，桃儿七和北美桃儿七(Podophyllum peltatum)具最近的亲缘关系。本研究对桃儿七叶绿体基因组特征进行分析并构建系统发育树，为日后保育、基因定位和进化分析提供支持。