草莓病毒1山东分离物全基因组分析

作     者：何成勇 赵晓丽 许腾飞 高德航 李世访 王红清 HE Chengyong;ZHAO Xiaoli;XU Tengfei;GAO Dehang;LI Shifang;WANG Hongqing

作者机构：中国农业大学园艺学院北京100193 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室北京100193 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2023年第50卷第1期

页      面：153-160页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：国家重点研发计划项目(2019YFD1001800) 国家重点研发计划政府间重点项目(2017YFE0010900)。 

主　　题：草莓 草莓病毒1 基因组全长 高通量测序 

摘      要：草莓病毒1(strawberry virus 1,StrV-1)属于弹状病毒科(Rhabdoviridae)细胞质弹状病毒属(Cytorhabdovirus),可侵染草莓。利用高通量测序(high-throughput sequencing,HTS)结合RT-PCR和RACE技术从采自山东省烟台市乳山市草莓种植基地的草莓品种‘全明星’上获得了StrV-1山东分离物(StrV-1-CN)的基因组全长(GenBank登录号:MW795715)。该分离物基因组全长为14051 nt,3ʹ和5ʹ非编码区序列分别为181和767 nt,其负义链含有9个开放阅读框(open reading frame,ORF),从3ʹ到5ʹ端分别编码N、Pʹ、P、P3、M、G、P6、P7和L等9个蛋白。序列分析表明,StrV-1-CN与已报道的StrV-1分离物基因组全长核苷酸序列一致性为77%~88%。系统发育分析结果表明,StrV-1-CN与捷克分离物B和1/2017聚在一个分支,亲缘性最近。