基于免疫浸润性相关LncRNA的食管腺癌预后模型的构建及风险分析

作     者：刘林壮 吴柳盛 侯清华 王汉文 刘继先 

作者机构：安徽医科大学北大深圳医院临床学院·北京大学深圳医院广东深圳518036 安徽医科大学研究生学院安徽合肥230032 北京大学深圳医院胸外科广东深圳518036 

出 版 物：《中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生》 

年 卷 期：2022年第10期

页      面：37-40页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：本工作得到了安徽省教育厅科研项目(YJS20210324)、北京大学-密歇根大学JI项目(编号:2019020(PUSH)-r1) 

主　　题：食管腺癌 免疫浸润 预测模型 LncRNA 

摘      要：本研究分析食管腺癌肿瘤细胞的免疫浸润情况,筛选LncRNA基因,构建食管腺癌预后模型,以评估患者的生存预后,探索潜在的治疗靶点。方法 在TCGA公共数据库中下载89例食管腺癌患者的资料,其中包括11例正常组织标本和78例食管腺癌肿瘤组织标本资料。本研究采用Perl和R软件进行代码运行和统计处理,计算患者的风险系数,随后进行Cox回归分析、免疫预后相关LncRNA生存分析、风险分析、PCA分析和ROC曲线分析。结果 我们筛选和鉴定了19个包含LINC01612、AC008443.2和LINC02582在内的预后生物标志物并构建预后模型,根据此模型将病人分为高风险组和低风险组,Kaplan‐Meier生存分析两组存在显著差异(P0.001)。同时,用ROC曲线评估食管腺癌预后模型的可行性,发现该模型具有较高的预测性(AUC0.964)。在这项研究中,对复杂的转录组测序数据和其他立方体进行PCA分析,以将数据转换到由特征向量构建的三维空间中。结论 本研究有效筛选和鉴定了与食管腺癌免疫侵袭相关的LncRNA,并成功构建了预后模型。LINC01612、AC008443.2和LINC02582等19个潜在的诊断和治疗靶基因,对食管腺癌患者的临床治疗具有一定的指导意义。