贵州平塘黑糯稻半矮秆突变体bgsd-2苗期与抽穗期转录组比较分析

作     者：刘慧 薛承进 赵兰馨 赵德刚 黄小贞 LIU Hui;XUE Chengjin;ZHAO Lanxin;ZHAO Degang;HUANG Xiaozhen

作者机构：贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心贵阳550025 贵州大学茶学院贵阳550025 贵州省农业科学院贵阳550006 

出 版 物：《种子》 (Seed)

年 卷 期：2023年第42卷第1期

页      面：7-12,44页

学科分类：08[工学] 09[农学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：贵州省科学技术基金(黔科合人才2053) 国家自然科学基金(31960615) 

主　　题：平塘黑糯 半矮秆 bgsd-2 转录组测序 发育时期 

摘      要：株高是水稻重要的农艺性状,与产量和品质密切相关。突变体bgsd-2在抽穗期与野生型平塘黑糯相比,表现出明显矮化,但是苗期株高没有显著差异。本研究在前期PTWT和bgsd-2抽穗期转录组数据的基础之上,进一步比较分析了PTWT和bgsd-2苗期和抽穗期两个发育阶段差异基因的动态变化。从4个比较组(PTWT-L与PTWT-F、bgsd-2-L与bgsd-2-F、PTWT-L与bgsd-2-L、PTWT-F与bgsd-2-F)中分别鉴定得到3984、3533、2107、1082个差异基因。KEGG分析发现,水稻苗期到抽穗期转变过程中,氨基酸的生物合成、淀粉和蔗糖代谢、碳代谢和核糖体等途径起重要作用。KEGG富集显示,bgsd-2突变位点可能直接影响苯丙烷生物合成和苯丙氨酸代谢两条途径相关基因表达。进一步分析不同比较组中差异转录因子变化的数量和类别,筛选到多个可能在bgsd-2从苗期到抽穗期转变过程中起作用的转录因子。