高通量转录组测序研究过表达Ocstamp对MLE-12细胞基因表达的影响
ALTERS GENES IN OVEREXPRESSION OF OC-STAMP IN MLE-12CELLS VIA HIGH-THROUGHPUT TRANSCRIPTOME SEQUENCING作者机构:华北理工大学基础医学院河北省唐山市063000 华北理工大学公共卫生学院 河北省器官纤维化重点实验室
出 版 物:《中国煤炭工业医学杂志》 (Chinese Journal of Coal Industry Medicine)
年 卷 期:2023年第26卷第1期
页 面:1-6页
学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100402[医学-劳动卫生与环境卫生学] 10[医学]
基 金:国家自然科学基金(编号:82003406) 河北省自然科学基金(编号:H2020209052) 河北省高等学校科学技术研究项目重点课题(编号:ZD2022127)
主 题:高通量转录组测序 破骨细胞刺激性跨膜蛋白 肺泡Ⅱ型上皮细胞
摘 要:目的 研究过表达Ocstamp对MLE-12细胞基因表达的影响。方法 构建稳定过表达Ocstamp和空载对照(NC)的MLE-12细胞并进行高通量转录组测序和生物信息学分析。蛋白免疫印迹法检测p-毛细血管扩张性共济失调突变激酶(ATM)、p-毛细血管扩张性共济失调(ATR)、p-p53、p21、p16、Ⅰ型胶原蛋白(Col Ⅰ)、Ⅲ型胶原蛋白(ColⅢ)、Ⅺ型胶原蛋白(Col Ⅺ)、己糖激酶2(HK2)、乳酸脱氢酶A(LDHA)、磷酸果糖激酶1(PFK1)、M2型丙酮酸激酶(PKM2)的表达,β半乳糖苷酶染色法检测细胞衰老。结果 高通量转录组测序结果显示,与NC组相比,过表达Ocstamp的MLE-12细胞中有2 794个差异基因,其中GO分析和KEGG分析显示衰老信号、糖酵解信号和胶原沉积信号出现了异常激活,蛋白免疫印迹结果显示,与NC组相比较,p-ATM、p-ATR、p-p53、p21、p16、Col Ⅰ、IColⅢ、Col Ⅺ、HK2、LDHA、PFK1、PKM2在Ocstamp过表达组中均上调(P0.05),且β半乳糖苷酶染色阳性。结论 过表达Ocstamp能介导MLE-12细胞衰老信号、糖酵解信号和胶原沉积等异常活化。