白菜HSP90基因家族的鉴定及表达分析

作     者：袁凌云 吴颖 张利婷 郑禹杉 聂立兵 朱世东 侯金锋 陈国户 唐小燕 汪承刚 Yuan Lingyun;Wu Yingi;Zhang Liting;Zheng Yushan;Nie Libing;Zhu Shidong;Hou Jinfeng;Chen Guohu;Tang Xiaoyan;Wang Chenggang

作者机构：安徽农业大学园艺学院合肥230036 安徽省皖江蔬菜产业技术研究院马鞍山238200 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年第20卷第24期

页      面：8064-8073页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31701910) 安徽省重点研究和开发计划项目(201904a06020057) 安徽省学术和技术带头人后备人选项目(2018H181)共同资助。 

主　　题：白菜 热激蛋白 全基因组鉴定 表达分析 

摘      要：本研究为了深入研究白菜(Brassica rapa)热激蛋白90(heat shock protein 90, HSP90)家族基因在温度胁迫下的响应机理及相关功能,利用生物信息学的方法对白菜HSP90基因家族成员进行了鉴定,同时分析了这些家族成员的理化性质、基因结构、进化关系、染色体分布、启动子元件以及表达模式。结果表明:白菜中至少含有14个HSP90基因,氨基酸长度在490~820之间,呈酸性,分布于10条染色体上,含有1~19个不等的内含子,10个保守基序;基于系统进化树分析,将14个基因分为5个簇;顺式作用元件分析得到7个响应温度胁迫基因;荧光定量分析表明这些基因在温度胁迫下存在显著差异,表明这些基因广泛参与温度胁迫响应。本研究为后续白菜HSP90基因功能挖掘提供科学参考。