瘤背石磺低频听力相关基因OrNXN克隆及表达分析

作     者：陈锡林 钱畅 肖海明 饶榕城 张小明 沈和定 CHEN Xilin;QIAN Chang;XIAO Haiming;RAO Rongcheng;ZHANG Xiaoming;SHEN Heding

作者机构：上海市水产动物良种创制与绿色养殖协同创新中心上海201306 上海海洋大学国家海洋生物科学国际联合研究中心上海201306 

出 版 物：《上海海洋大学学报》 (Journal of Shanghai Ocean University)

年 卷 期：2023年第32卷第1期

页      面：10-19页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：协同创新中心任务团队经费项目(A1-3605-21-000202) 

主　　题：瘤背石磺 OrNXN 基因筛选 低频听力 潮汐 

摘      要：从瘤背石磺不同频率声音基因转录组中将有显著差异表达的基因与IMPC人类听觉感知和耳聋相关基因对比发掘出与听力相关的基因NXN。利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得OrNXN基因cDNA全长序列,并对其序列进行生物信息学分析;利用实时定量PCR(qPCR)技术分析OrNXN在瘤背石磺不同组织、不同声音频率及不同潮汐节点的表达水平。结果显示,OrNXN基因cDNA全长为1593 bp,开放阅读框长度为432 bp,共编码143个氨基酸,相对分子质量为15.57 ku;结构域预测分析表明,OrNXN含有Thioredoxin家族典型的硫氧还蛋白结构;多序列比对以及进化树构建结果表明,OrNXN与其他物种的相似度较高,保守性较强;荧光定量结果表明,在瘤背石磺7个组织中OrNXN在肠、神经节、性腺和腹足中均有表达,在肠中表达量最高,其次为神经节。不同声音频率刺激下,OrNXN在200和50 Hz处有差异表达,在不同潮汐节点,OrNXN表达量均不同,表达量基本与潮汐水位变化一致。研究表明,OrNXN可能在瘤背石磺参与感知潮汐节率时对潮汐发出的低频声音产生了响应。