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基于WGS的学生与环境MRSA菌株间毒素基因的相互关联分析

Correlation of toxin genes between students and environmental MRSA strains based on WGS

作     者:郭嘉佳 张文萃 贡梓军 梁月朗 程琦 姚振江 GUO Jia-jia;ZHANG Wen-cui;GONG Zi-jun;LIANG Yue-lang;CHENG Qi;YAO Zhen-jiang

作者机构:广东药科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系 

出 版 物:《现代预防医学》 (Modern Preventive Medicine)

年 卷 期:2023年第50卷第1期

页      面:151-158页

学科分类:1010[医学-医学技术(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基  金:广东省科技计划项目(2014A020213013) 

主  题:MRSA 学生与环境 毒素基因 全基因组测序 

摘      要:目的 探究学生鼻腔和学校环境耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant staphylococcus aureus, MRSA)的毒素基因情况及遗传相似性。方法 利用全基因组测序技术,比较广州市8所小学学生和环境中MRSA的毒素基因情况。采用χ2检验或Fisher确切概率法分析毒素基因种类和数目的差异,构建系统进化树和聚类分析比较学生与环境的毒素基因谱。结果 检出的135株MRSA中,学生与环境均携带以溶血毒素(hlgA、hlgB、hlgC)(96.88%~100.00%)和胞外酶基因(aur)(98.06%~100.00%)为主的毒素基因。在种类上,34种毒素基因除部分肠毒素基因(sec3、seg、sei、sem、sen、seo、seu)外,其余均无统计学差异(P0.05);在携带基因数目上,除携带12种毒素基因在二者之间有差异(χ2=12.35,P0.05)。此外,hlgA-hlgB-hlgC-aur-scn-sak和seg-sei-sem-sen-seo-seu为学生和环境MRSA的主要毒素基因谱,分别为(85.44%,81.25%)和(48.54%,71.88%)。不同分子型别MRSA与毒素基因模式之间存在关联(P0.001)。结论 学生与环境MRSA的毒素基因种类、数目相近,主要的毒素基因模式相同,种系进化树聚集,二者间存在较高的关联性,提示菌株在学生与环境中可能存在交叉传播现象。

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