基于高通量测序的粉尘螨体内细菌多样性研究

作     者：周小倩 马杰 王睿怡 王若航 吴毅强 杨欣宴 陈玉娟 唐小牛 孙恩涛 ZHOU Xiao-qian;MA Jie;WANG Rui-yi;WANG Ruo-hang;WU Yi-qiang;YANG Xin-yan;CHEN Yu-juan;TANG Xiao-niu;SUN En-tao

作者机构：皖南医学院医学寄生虫学教研室安徽芜湖241002 皖南医学院卫生检验与检疫学教研室安徽芜湖241002 皖南医学院公共卫生学院环境卫生学与职业卫生学教研室 

出 版 物：《中国血吸虫病防治杂志》 (Chinese Journal of Schistosomiasis Control)

年 卷 期：2022年第34卷第6期

页      面：630-634页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(31870352) 安徽省省级大学生创新创业项目(S202110368010)。 

主　　题：粉尘螨 细菌多样性 16S核糖体RNA 高通量测序 

摘      要：目的探讨粉尘螨(Dermatophagoides farinae)体内细菌多样性。方法取实验室人工饲养的粉尘螨,采用Illumina PE250高通量测序平台扩增测序细菌16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA,16S rRNA)基因V4区,获得的原始序列经质控过滤后得到有效序列。采用Usearch软件、Silva数据库、Mothur软件对有效序列进行操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)聚类并分析细菌群落组成与alpha多样性指数。结果共获得187616条有效序列,根据序列相似性97%进行聚类,得到469个OTUs。OTU注释结果表明,粉尘螨体内细菌分属于26个门、43个纲、100个目、167个科、284个属。在门分类阶元水平,粉尘螨体内细菌主要注释到变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和酸杆菌门,其中变形菌门为优势菌门;在属分类阶元水平,罗尔斯通氏菌属、立克次体目未确定属、葡萄球菌属和鞘氨醇单胞菌属为优势菌属。在非优势菌属中,发现沃尔巴克氏体。结论粉尘螨体内细菌群落组成具有较高多样性,个体间细菌群落多样性与丰度存在差异。