杆状病毒泛素蛋白的序列及分子进化分析
Sequence and Molecular Evolution Analysis of Ubiquitin Proteins Encoded by Baculoviruses作者机构:江苏大学生命科学研究院江苏镇江212013
出 版 物:《安徽农业科学》 (Journal of Anhui Agricultural Sciences)
年 卷 期:2010年第38卷第35期
页 面:19933-19937页
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 0828[工学-农业工程] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种]
基 金:中国博士后科学基金项目(20100471387) 江苏省高校自然科学基础研究项目(07KJB180013) 江苏大学高级人才基金项目(05JDG048)
摘 要:[目的]分析杆状病毒泛素蛋白的序列特征和分子进化。[方法]运用Clustal W软件进行序列多重联配分析,采用临近法(NJ)和最大简约法(MP)构建系统进化树。[结果]昆虫杆状病毒泛素与真核生物泛素的一致性为73%~86%,差异体现在氨基酸15~32和53~57的序列上,其他序列高度保守。在真核生物泛素蛋白序列中,许多功能性的氨基酸残基在昆虫杆状病毒泛素蛋白序列中也存在。系统进化分析将昆虫杆状病毒和真核生物泛素蛋白大致分为3个亚家族,即GV族、Ⅰ族和Ⅱ族。杆状病毒泛素基因采取负选择的进化方式,在长期进化过程中,其氨基酸序列倾向于逐渐被固定下来,达功能和结构上的稳定。[结论]分析杆状病毒泛素的序列特征和分子进化,为进一步研究其生物学功能提供参考。