表达谱芯片对灰绿藜和水稻NHX1基因在转基因拟南芥中表达差异的研究
Study on NHX1 Gene Functional Comparisons between Chenopodium glaucum and Oriza sativa Using Affymetrix Gene Chips in Transgenic Arabidopsis作者机构:新疆大学生命科学与技术学院/新疆生物资源基因工程重点实验室乌鲁木齐830046
出 版 物:《新疆农业科学》 (Xinjiang Agricultural Sciences)
年 卷 期:2010年第47卷第1期
页 面:1-6,F0003页
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学]
基 金:新疆维吾尔自治区科技重大专项(200731138-3) 国家"973"计划前期研究专项(2009CB126006)
摘 要:【目的】基因芯片作为高通量、高效率的DNA分析技术,已被广泛地用于植物抗逆性功能基因的分析之中。为探讨盐生植物和甜土植物NHX1基因调控盐应答过程和亲水性C端的功能研究提供借鉴,进一步揭示盐生植物和甜土植物耐盐机制的差异,为植物耐盐机理的实际应用提供依据。【方法】利用Affymetrix拟南芥表达谱芯片对过表达盐生植物灰绿藜和甜土植物水稻NHX1基因及缺失部分C端基因的转基因拟南芥进行基因表达差异的分析。【结果】在盐胁迫的转基因拟南芥组织中,筛选出在四组转基因型拟南芥中共同差异表达的基因有394条,占筛选基因总数的1.64%,其中上调表达的基因有177条,下调表达的基因有217条。将这些差异基因初步分为12类,包括非生物性与生物性刺激的应答过程、胁迫应答过程、电子转移和能量途径、信号转导和转录等功能类别。【结论】表明植物耐盐过程是一个多基因参与的复杂的变化过程,涉及到许多相关基因的变化。联系两两比较散点图和聚类分析结果从理论上说明,转基因拟南芥cgNHX1,cgNHX1dc,osNHX1和osNHX1dc耐盐性有依次减弱的趋势。