茶网蝽线粒体基因组全序列测定及系统发育分析

作     者：杨金宏 谢满超 文欣茹 陈蕊茹 孔卫青 YANG Jinhong;XIE Manchao;WEN Xinru;CHEN Ruiru;KONG Weiqing

作者机构：安康学院现代农业与生物科技学院/陕西省茶叶省市共建重点实验室陕西安康725000 安康学院陕西省蚕桑重点实验室陕西安康725000 

出 版 物：《茶叶科学》 (Journal of Tea Science)

年 卷 期：2022年第42卷第6期

页      面：839-850页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090203[农学-茶学] 0902[农学-园艺学] 

基　　金：陕西省重点研发计划(2018ZDXM-NY-057) 安康市科技发展计划(AK2021-NY-2) 安康学院科研项目(2017AYXNZX11)。 

主　　题：茶网蝽 线粒体基因组 序列分析 系统发育 

摘      要：为明确茶网蝽(Stephanitis chinensis)线粒体基因组序列特征,探究其系统发育地位。利用Illumina和Sanger测序对陕西省安康市茶网蝽线粒体基因组进行测定。结果显示,茶网蝽线粒体基因组全长18085 bp,包含37个基因(13个蛋白质编码基因,22个tRNA,2个rRNA)和1个3678 bp的控制区,基因排列与昆虫线粒体祖先基因顺序(Ancestralgeneorder)相同。基因组AT含量为78.10%。13个蛋白质编码基因中,6个以ATG起始,7个以ATT或ATA起始,10个以TAA或TAG为终止密码子,cox2、atp6和cox3以T终止,蛋白质编码基因使用频率最高的密码子是UUA、AUU、UUU和AUA,使用频率最高的氨基酸为亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(Ile)、苯丙氨酸(Phe)和丝氨酸(Ser)。22个tRNA基因存在GU、UU、GA和AA错配23处,trnS1(GCU)缺少DHU臂,其他tRNA均能形成典型三叶草结构。控制区包含位于前端的3种非串联重复、4个(TTAG)_(n)和1个位于后端的串联重复序列,含有多个茎环结构。系统发育分析结果表明,茶网蝽与直脊冠网蝽(Stephanitis mendica)的亲缘关系最近,所有网蝽科聚为一簇,位于发育树的根部。