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鲍曼不动杆菌abaI基因的克隆表达分析、同源建模及分子对接分析

Cloning and expression analysis,homology modeling and molecular docking of abaI gene in Acinetobacter baumannii

作     者:乔霞 苏雅静 康宇婷 汪澎涛 贾伟 QIAO Xia;SU Ya-jing;KANG Yu-ting;WANG Peng-tao;JIA Wei

作者机构:宁夏医科大学总医院宁夏临床病原微生物重点实验室宁夏银川750004 宁夏医科大学总医院医学实验中心宁夏银川750004 

出 版 物:《化学研究与应用》 (Chemical Research and Application)

年 卷 期:2022年第34卷第12期

页      面:2886-2893页

学科分类:07[理学] 070105[理学-运筹学与控制论] 0701[理学-数学] 

基  金:本项目研究由宁夏自然科学基金项目(2019AAC03223)资助。 

主  题:鲍曼不动杆菌 abaI 生物被膜 克隆与表达 分子对接 

摘      要:高丝氨酸内脂合成酶(homoserine lactone synthase,abaI)是导致鲍曼不动杆菌生物被膜形成的关键酶之一,对其结构功能的研究有助于我们对抑制生物被膜形成有很大帮助。本研究通过Genebank查找abaI(A1S_0109)蛋白序列,运用分子技术对其进行表达分析,应用生物分析软件ExPASy、ESPript、MEG5.0、SWISS-MODEL等对其进行结构分析,使用分子对接软件分析抑制剂的关键结合位点。结果显示,在含有pET28a-abaI重组质粒BL21菌株与野生BL21菌株相比生物被膜形成能力以及运动性显著增高。从生成生物膜被膜的定义上,BL21从不产生物被膜菌株,变成了产膜菌株。预测其结构蛋白与TofI蛋白高度相似,通过分子对接首次揭示abaI蛋白抑制剂与abaI蛋白相互作用关系。研究结果显示abaI在BL21中能够促使生物被膜的形成和增强细菌的运动,分子对接揭示了abaI蛋白的相互作用位点,为进一步研究其活性以及抑制剂提供了重要的参考信息。

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