文心兰花瓣转录组分析与调控花瓣衰老关键基因挖掘

作     者：李晨 裴小华 王帅 曲飞鸿 薛唯佳 徐丹 李梦桃 王鹏 张恒 潘英文 夏志强 刘进平 Li Chen;Pei Xiaohua;Wang Shuai;Qu Feihong;Xue Weijia;Xu Dan;Li Mengtao;Wang Peng;Zhang Heng;Pan Yingwen;Xia Zhiqiang;Liu Jinping

作者机构：海南大学热带作物学院海南省热带生物资源可持续利用重点实验室海口570228 海南出入境检验检疫局热带植物隔离检疫中心海口570311 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年第20卷第22期

页      面：7354-7364页

学科分类：090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 09[农学] 

基　　金：海南省基础与应用基础研究计划(自然科学领域)高层次人才项目(2019RC147) 海南省重点研发计划项目(ZDYF2020053) 五指山市科技和工业信息化局项目(WZSKTPXM2021005) 国家自然科学基金项目(31560573)共同资助 

主　　题：文心兰(Oncidium) 花瓣衰老 RNA测序 转录组 

摘      要：花瓣衰老是观赏园艺植物具有经济价值的重要性状。为了解文心兰衰老花瓣的转录组学特征,挖掘参与调控文心兰花瓣衰老的关键基因,本研究对盛开期(E)、衰老初期(F)和衰老期(G)的文心兰切花花瓣进行RNA测序。测序序列经组装拼接后,共获得48661个Unigenes,在NR、NT、SwissPort、KEGG、COG、InterPro、GO数据库中分别注释到34922(71.77%)、26286(54.02%)、23134(47.54%)、25678(52.77%)、14483(29.76%)、25580(52.57%)和9103(18.70%)条Unigenes。经表达量比较,在盛开期(E)和衰老初期(F)之间获得差异表达基因3914条,衰老初期(F)和衰老期(G)之间获得差异表达基因1579条。经GO功能富集分析,花瓣盛开期(E)和衰老初期(F)共有3914、衰老初期(F)和衰老期(G)之间共有1579条差异表达基因被注释参与生物学过程、细胞组分和分子功能三个功能组。KEGG功能富集分析表明,盛开期(E)和衰老初期(F)之间的差异表达基因参与18个代谢通路,而衰老初期(F)和衰老期(G)之间的差异表达基因参与7个代谢通路。鉴定出可能在文心兰花花瓣衰老发挥关键作用的一批包括乙烯、生长素、赤霉素、茉莉酸、脱落酸及细胞分裂素在内的植物生长调节物质的合成与信号转导相关基因和转录因子基因。本研究所获得的文心兰花瓣衰老转录组数据,为进一步鉴定衰老相关基因的功能,了解花瓣衰老分子机制打下基础。