团头鲂SOCS家族基因的分子特征及其对嗜水气单胞菌胁迫的响应

作     者：翟文娅 李博 王济秀 王焕岭 刘红 ZHAI Wenya;LI Bo;WANG Jixiu;WANG Huanling;LIU Hong

作者机构：华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室/长江经济带大宗水生生物产业绿色发展教育部工程研究中心武汉430070 

出 版 物：《华中农业大学学报》 (Journal of Huazhong Agricultural University)

年 卷 期：2022年第41卷第6期

页      面：222-229页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071002[理学-动物学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31972781) 现代农业产业技术体系国家大宗淡水鱼产业技术体系建设专项(CARS-45-01) 

主　　题：团头鲂 嗜水气单胞菌 socs基因 细菌性败血症 抗细菌感染 免疫应答 

摘      要：为探究团头鲂细胞因子信号转导抑制因子(suppressor of cytokine signaling,SOCS)家族基因的序列特征和功能,从NCBI数据库获取socs1、socs2、socs3a、socs3b、socs4、socs5a、socs5b、socs6、socs7、socs9共10个socs基因的cDNA序列,利用ExPASy、SMART等在线网站对其进行生物信息学分析,预测团头鲂10个SOCS的理论分子质量、理论等电点与结构域等分子特性。系统进化(MEGA 6软件)分析结果显示,10个SOCS可分为2个亚族:Ⅰ型亚族包括SOCS4、SOCS5a、SOCS5b、SOCS6、SOCS7与SOCS9,Ⅱ型亚族包括SOCS1、SOCS2、SOCS3a与SOCS3b。半定量PCR结果显示,健康团头鲂10个socs基因在被检测组织中具有明显的组织特异性,socs1、socs2、socs3在多个组织中表达量较高。在嗜水气单胞菌感染后,采用实时定量PCR检测团头鲂socs基因在脾脏、体肾、头肾中的表达量,其中socs1、socs2、socs3a、socs3b表达量均显著上调。结果表明,团头鲂SOCS家族基因的表达模式各不相同,预示其功能的多样性,其中socs1、socs2、socs3在免疫应答中发挥重要作用。