新疆旱獭肠道RNA病毒的宏转录组学研究

作     者：颜广智 孙悦 闫晓敏 陈俊杰 赵梓含 屈勇刚 涂长春 黄良宗 何彪 YAN Guang-zhi;SUN Yue;YAN Xiao-min;CHEN Jun-jie;ZHAO Zi-han;QU Yong-gang;TU Chang-chun;HUANG Liang-zong;HE Biao

作者机构：佛山科学技术学院生命科学与工程学院广东佛山528000 中国农业科学院长春兽医研究所长春130122 石河子大学动物科技学院新疆石河子832003 

出 版 物：《军事医学》 (Military Medical Sciences)

年 卷 期：2022年第46卷第7期

页      面：534-539页

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：国家自然科学基金(32022083)。 

主　　题：新疆 旱獭属 宏转录组学 RNA病毒 进化分析 

摘      要：目的了解新疆地区旱獭(Marmota)肠道携带RNA病毒的病原本底。方法采用宏转录组学方法对新疆喀什地区14只健康旱獭肠道样品进行病毒组分析。结果基于重叠序列(contig)水平共注释到5个脊椎动物病毒科,分别为星状病毒科、小RNA病毒科、呼肠孤病毒科、圆环病毒科和腺病毒科。根据病毒宏转录组学结果,对注释到的病毒进行检测与进化分析,发现心病毒、嵴病毒、摩萨病毒与参考毒株同源性较高,为这些病毒变异株,而肠道病毒、腺病毒与已知病毒具有明显的遗传差异,可能为该病毒新种;星状病毒与其他旱獭源星状病毒之间氨基酸同源性差异较大,显示星状病毒在旱獭体内具有遗传多样性。值得注意的是,旱獭轮状病毒与牛轮状病毒核苷酸同源性高达92%,表明该病毒可能经过粪口途径实现跨种传播。结论该研究揭示了旱獭肠道携带RNA病毒的多样性,为了解旱獭病毒本底、监测病毒传播生态链提供了重要数据。