转录组测序评价烤烟N导入片段近等基因系的连锁累赘

作     者：刘勇 黄昌军 于海芹 袁诚 曾建敏 

作者机构：云南省烟草农业科学研究院国家烟草基因工程研究中心烟草行业烟草生物技术育种重点实验室 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：中国烟草总公司云南省公司项目(2018530000241003)资助 

摘      要：为了从全基因组表达角度了解短N导入片段降低烤烟抗性连锁累赘的效果，对近等基因系打顶后35 d上部第3片叶进行了转录组测序及生物信息学分析。结果表明：与对照‘云烟87’(‘Y87’)相比，长N导入片段近等基因系(‘Y87NL’)的上调表达、下调表达基因数量最多，分别为3 183和2 925个。短N导入片段近等基因系(‘Y87NS2’， ‘Y87NS5’)的差异表达基因数量比‘Y87NL’减少33.0%～56.8%。‘Y87NL’的上调表达、下调表达lncRNA数量最多，分别为1 406和1 785个。短N导入片段近等基因系的差异表达lncRNA数量比‘Y87NL’减少26.6%～46.3%。差异表达基因类型与数量、代谢通路富集分析表明：短N导入片段近等基因系在取样时间点的全基因组表达情况比‘Y87NL’更加类似‘云烟87’，短N导入片段降低了长N导入片段对‘云烟87’基因表达的扰动。综合成熟期上部叶转录组测序分析结果，短N导入片段近等基因系降低了连锁累赘。本研究结果可为短N导入片段近等基因系的育种利用提供参考依据。