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基于叶绿体基因的药用梅群体遗传学研究

Analysis of population genetics of medicinal plum based on chloroplast gene

作     者:欧金梅 杨亚湉 钱程程 吴瑞 王瑞 黄璐琦 OU Jin-mei;YANG Ya-tian;QIAN Cheng-cheng;WU Rui;WANG Rui;HUANG Lu-qi

作者机构:安徽中医药大学安徽合肥230012 中国中医科学院中药资源中心北京100700 安徽省中医药科学院中药资源保护与开发研究所安徽合肥230012 芜湖职业技术学院安徽芜湖241006 

出 版 物:《中草药》 (Chinese Traditional and Herbal Drugs)

年 卷 期:2022年第53卷第17期

页      面:5469-5475页

核心收录:

学科分类:1006[医学-中西医结合] 10[医学] 100602[医学-中西医结合临床] 

基  金:名贵中药资源可持续利用能力建设项目(2060302-2201-23) 中央财政林业科技推广示范资金项目(Z175070050002)。 

主  题: 叶绿体基因 群体遗传学 谱系地理学 psbA-trnH rps16 trnS-trnG ycf1b 

摘      要:目的 对药用梅Prunusmume开展群体遗传学研究,揭示其遗传变异情况、单倍型地理分布格局,推测其起源和多样化中心。方法 采用叶绿体基因片段(psb A-trn H、rps16、trn S-trnG、ycf1b)对我国23个地区的药用梅野生群体进行测序,开展群体遗传多样性、遗传结构和历史动态分析。结果 药用梅共检测出20个单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.790,核苷酸多样性(π)为0.001 71。AMOVA分析显示,药用梅在cp DNA水平上的遗传变异主要发生在群体间,表明该物种具有明显的谱系地理结构,群体间基因流主要以花粉流为主。中性检验和失配分布分析表明药用梅群体历史是基本稳定的,没有经历明显的快速扩张事件。单倍型中H2是分布最广泛的共享单倍型,H1、H15位于单倍型网络图中心位置。结论 药用梅具有明显的谱系地理结构,群体遗传性较高,四川、福建作为药用梅主产区,也是其起源和多样化中心。

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