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基于SCoT标记的披碱草属种质遗传多样性分析及指纹图谱构建

Genetic diversity analysis and fingerprint construction of Elymus germplasm based on SCoT markers

作     者:潘静 张俊超 陈有军 周青平 PAN Jing;ZHANG Jun-chao;CHEN You-jun;ZHOU Qing-ping

作者机构:西南民族大学青藏高原研究院四川成都610041 四川省抗逆牧草种质创新及生态修复工程实验室四川成都610041 四川若尔盖高寒湿地生态系统国家野外科学观测研究站四川成都610041 

出 版 物:《草业学报》 (Acta Prataculturae Sinica)

年 卷 期:2022年第31卷第11期

页      面:48-60页

核心收录:

学科分类:090503[农学-草业科学] 0909[农学-草学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基  金:国家牧草产业技术体系(CAS34) 西南民族大学中央高校基本科研业务专项经费项目(2021PTJS30) 西南民族大学中央高校优秀学生培养工程项目(2021NYYXS03)资助 

主  题:披碱草属 SCoT分子标记 遗传多样性 指纹图谱 

摘      要:本研究利用SCoT分子标记对青藏高原披碱草属3个物种的种质资源开展遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建,为不同物种的材料鉴定提供理论依据。在80个SCoT引物中筛选出22条引物进行PCR扩增,共扩增出290个条带,其中多态性条带254个,多态性条带比率占87.59%。Shannon多样性信息指数(I)、Nei’s基因多样性指数(H)、观察等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)的平均值分别为:0.5411、0.3643、1.9856和1.6270。聚类分析结果表明,遗传相似系数变化范围为0.50~0.80,在遗传相似系数为0.53处,可将46份材料分为2个组群,主坐标分析结果与聚类分析结果保持一致,同时利用4个SCoT引物构建了46份材料的DNA指纹图谱。SCoT分子标记适用于披碱草属种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建,该研究为野生披碱草属种质鉴定、优质性状挖掘、育种实践提供了理论基础。

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