基于F群体的玉米株高与穗位高的全基因组关联分析

作     者：梁航宇 叶凡 董远 李婷 段迎新 刘斌斌 李周帅 徐淑兔 张兴华 薛吉全 

作者机构：西北农林科技大学农学院/农业农村部西北旱区玉米生物学与遗传育种重点实验室 陕西省玉米工程技术研究中心 

出 版 物：《西北农业学报》 (Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica)

年 卷 期：2022年

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：现代农业产业技术体系专项(玉米)(CARS-02) 

摘      要：株高、穗位高是影响玉米耐密性的重要株型性状,明确玉米株高、穗位高的遗传基础有利于株型改良。以基于NCⅡ遗传交配设计,以陕A群和陕B群选育的85个自交系组配的246份F群体为材料,进行株型表型评价,同时结合55 951个高质量SNPs标记,对株高、穗位高以及穗位系数进行全基因组关联分析。结果表明:株高、穗位高、穗位系数的遗传力分别为77.68%、77.04%、73.78%,且三者之间存在显著正相关。同时,通过全基因组关联分析检测到了7、5、4个SNP与株高、穗位高和穗位系数显著相关,解释1.47%～25.27%表型变异。通过候选基因功能注释,共筛选到了10个候选基因,涉及植物的生长发育、生物合成、响应非生物胁迫等过程,针对3个共定位区间和热点区间锚定了plt1、atp2、ZC3H46、emp21等为候选基因。可见,通过株型表型鉴定及相关基因的挖掘,可为陕A群和陕B群两个玉米群体的株型改良提供理论基础。