棘皮动物育种数据管理与分析平台的开发及应用

作     者：李彬 王卫军 王扬帆 孙国华 徐晓辉 冯艳微 李赞 崔翠菊 杨建敏 LI Bin;WANG Wei-Jun;WANG Yang-Fan;SUN Guo-Hua;XU Xiao-Hui;FENG Yan-Wei;LI Zan;CUI Cui-Ju;YANG Jian-Min

作者机构：鲁东大学农学院山东烟台264025 烟台海育海洋科技有限公司山东烟台264004 中国海洋大学山东青岛266003 山东华春渔业有限公司山东东营257200 

出 版 物：《海洋与湖沼》 (Oceanologia Et Limnologia Sinica)

年 卷 期：2022年第53卷第5期

页      面：1225-1233页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家重点研发计划,2018YFD0901601号,2018YFD0901602号 山东省泰山产业领军人才,TSCY20190114号 山东省现代农业产业技术体系刺参创新团队,SDAIT-22-02号。 

主　　题：棘皮动物 育种数据 信息管理 遗传参数 平台开发 

摘      要：以刺参为代表的高价值棘皮动物在我国的养殖规模不断扩大,市场价值越来越高,但有关棘皮动物育种数据管理与分析的系统并未开发。本平台是以ASReml软件为遗传评估核心,使用Mysql数据库和java、R语言,利用maven、myeclipse2017工具开发的一套基于B/S框架,在Linux环境下运行的育种数据管理与分析系统。平台包含6大功能模块:系统管理、种质信息、表型数据库、表型数据分析、基因组数据库和基因组数据分析等。能实现棘皮动物表型数据、系谱数据和基因组数据的管理、育种值分析、遗传力估算、近交和亲缘系数计算、遗传进展计算和选种配种方案制定。运用该平台对刺参育种模拟数据进行管理、分析与应用,利用模拟表型数据和基因组数据对刺参的棘刺、体重进行了遗传力分析和育种值计算,并提出选种配种方案。该平台的推广和应用将提升棘皮动物育种效率,对我国棘皮动物育种工作的发展具有重要的促进作用。