结球甘蓝细胞质雄性不育转录组分析及不育基因的挖掘

作     者：于存申 张晓烜 于雅楠 王超 

作者机构：东北农业大学园艺园林学院 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2022年

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：国家重点研发项目(2016YFD0101702-6)资助 

摘      要：为探究结球甘蓝雄性不育系PM在花蕾败育期与保持系PF及具有恢复能力的品系PR在分子功能上的差异，分别在花蕾败育期取结球甘蓝三系蕾长1～3 mm的花蕾，提取RNA并进行转录组测序分析。结果表明：PM与PF共鉴别到差异基因1 463个；PM与PR共鉴别到差异基因3 954个；PF与PR共鉴定到差异基因1346个。通过GO富集分析显示这些基因在生物过程主要富集在细胞过程和代谢过程；细胞组分中在胞内区域、细胞解剖实体富集最多；分子功能富集最多的主要是催化活性与结合过程。Pathway显著富集较多的代谢通路有糖酵解/糖异生、昼夜节律-植物、脂肪酸降解、植物激素信号转导、α-亚麻酸代谢、氨基酸的生物合成等途径。此外，随机选取16个差异基因进行了qRT-PCR表达分析，结果与RNA-Seq数据基本一致，证明转录组数据的准确性。通过对转录组差异基因分析，找到了4个有关花药败育的基因，为进一步验证基因功能提供了研究基础。