不明原因复发性流产患者的基因表达谱亚组分析

作     者：林泳煌 刘兴华 王红心 杨晓雨 樊文龙 陈东宇 何玉清 

作者机构：广东医科大学公共卫生学院流行病与医学统计学系广东东莞523808 广东医科大学寮步医院广东东莞523400 

出 版 物：《中国妇幼保健》 (Maternal and Child Health Care of China)

年 卷 期：2022年第37卷第19期

页      面：3629-3634页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100211[医学-妇产科学] 10[医学] 

主　　题：复发性流产 亚组分析 批次效应 一致性聚类 

摘      要：目的探讨不明原因的复发性流产(RSA)患者的基因表达谱的异质性,确定亚组子宫内膜生物学过程的区别。方法从GEO数据库中获取GSE165004和GSE26787基因表达序列,应用ComBat方法去除批次效应后,应用Consensus Clustering方法对29个病例组进行无监督聚类并分成3个亚组(RSA1、RSA2、RSA3),3个亚组再分别与对照组进行差异表达分析。利用GO富集和KEGG富集对差异表达基因(DEGs)进行生物学功能和途径注释。应用cytoHubba识别中心基因。结果RSA1和对照组主要富集在与核分裂、细胞分裂等细胞周期相关,代谢途径有蛋白质消化吸收和细胞外基质(ECM)受体相互作用;RSA2组和脂质、氨基酸代谢过程的调控有关,代谢途径主要有花生四烯酸代谢和甲状腺激素合成;RSA3组和金属离子等细胞信号有关。结论RSA1亚组的细胞周期明显失调;RSA2亚组的脂质、氨基酸代谢失调;RSA3亚组的细胞信号失调。