基于整合药理学和转录组学的天龙咳喘灵抗特发性肺动脉高压可行性分析及作用机制

作     者：林范杰 李东蕾 林肯 陈少琪 卢文菊 LIN Fanjie;LI Donglei;LIN Ken;CHEN Shaoqi;LUWenju

作者机构：呼吸疾病国家重点实验室国家呼吸系统疾病临床医学研究中心广州呼吸健康研究院广州医科大学附属第一医院广东广州510030 广州医科大学广东广州510030 

出 版 物：《中国中医药信息杂志》 (Chinese Journal of Information on Traditional Chinese Medicine)

年 卷 期：2022年第29卷第10期

页      面：30-39页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 100506[医学-中医内科学] 1006[医学-中西医结合] 1005[医学-中医学] 10[医学] 100602[医学-中西医结合临床] 

基　　金：广东省“珠江人才计划”本土创新科研团队(2017BT01S155) 广东省自然科学基金(2020A1515010076、2021A1515011346) 广州市教育局协同创新重大项目(1201620007) 

主　　题：天龙咳喘灵 特发性肺动脉高压 网络药理学 分子对接 转录组学 

摘      要：目的基于整合药理学和转录组学探究天龙咳喘灵抗特发性肺动脉高压(IPAH)的可行性及作用机制。方法通过TCMSP、本草组鉴(HERB)数据库收集天龙咳喘灵活性成分,利用SwissTargetPrediction、HERB数据库查找活性成分对应靶点,利用GeneCards、DisGeNET数据库获取IPAH疾病靶点;通过OmicShare在线平台构建维恩图,得到天龙咳喘灵抗IPAH关键靶点;利用Cytoscape3.8.0软件构建药物-成分-疾病-靶点网络,依据度值筛选核心成分;利用STRING数据库得到关键靶点蛋白相互作用网络,导入Cytoscape3.8.0软件进行网络拓扑学分析,结合药物-成分-疾病-靶点网络进一步筛选出核心靶点;通过R clusterProfiler 3.16.1对关键靶点进行GO和KEGG通路富集分析;运用殷赋科技在线平台、AutoDock4.2.6、PyMOL2.4软件进行分子对接;使用x Cell评分估计IPAH肺组织的差异细胞类型,并分析其与核心靶点的相关性。结果得到天龙咳喘灵活性成分160种、IPAH疾病靶点86个;核心成分包括槲皮素、腺苷、熊果酸等9种,核心靶点包括PTGS2、NOS2、ADRB2和VEGFA;GO富集分析筛选得到925个生物过程、11个细胞组分、22个分子功能条目,KEGG通路富集分析得到48条通路;分子对接结果显示,核心成分与核心靶点几乎均可自发结合,其中熊果酸与核心靶点的平均结合能最小,结合活性最好;相关性分析结果表明,PTGS2和VEGFA与多种细胞类型显著相关。结论本研究从整合药理学和转录组学角度初步阐明天龙咳喘灵抗IPAH多成分、多靶点、多途径的整体调节特点,与微阵列芯片验证结果基本相符,可为后续药理学研究和临床应用提供依据与参考。