MALDI-TOF MS自建库对不同来源大肠埃希菌的鉴定能力验证
Identification of Escherichia coli from different sources by MALDI-TOF MS self-built database作者机构:新疆医科大学第一附属医院药学部乌鲁木齐830054 新疆医科大学第五附属医院检验科乌鲁木齐830011
出 版 物:《新疆医科大学学报》 (Journal of Xinjiang Medical University)
年 卷 期:2022年第45卷第8期
页 面:818-822页
学科分类:1010[医学-医学技术(可授医学、理学学位)] 10[医学]
基 金:新疆维吾尔自治区区域协同创新专项(科技援疆计划)项目(2019E0290) 2021年新疆维吾尔自治区研究生创新项目(XJ2021G232)
主 题:MALDI-TOF MS 蛋白质指纹图谱 大肠埃希菌 自建库 鉴定能力
摘 要:目的 收集并建立具有特征的大肠埃希菌MALDI-TOF MS自建库,并观察自建库对不同来源大肠埃希菌菌株的鉴定能力。方法 采集2019年3月-2020年8月新疆医科大学第五附属医院检验科临床标本分离出的142株人源性大肠埃希菌菌株;采集自北京市怀柔区和延庆区养殖场分离出的40株动物源性大肠埃希菌菌株。通过16S rRNA测序确定其种属,并进行MALDI-TOF MS鉴定,筛选出合格的蛋白质指纹图谱,使用MicroID 4.0自建库功能对其进行建库。分别使用本地及北京收集的大肠埃希菌菌株对自建库进行验证,评估自建库对不同来源的大肠埃希菌的鉴别区分能力。结果 基于40株合格的人源性大肠埃希菌菌株的蛋白指纹图谱建立自建库,人源性与动物源性大肠埃希菌菌株对自建库进行验证,鉴定结果分别为96%、83%高度可信,其鉴定结果可信程度差异有统计学意义(P0.05)。结论 本次建立的自建库可用于区分鉴定人源性与动物源性的大肠埃希菌菌株,自建库的4个代表性特征峰具有地域特征,可用作不同地区菌株的鉴别与参考图谱数据库的补充。